Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tcp1P11983 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tcp1P11983 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tcp1P11983 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tcp1P11983 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tcp1P11983 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tcp1P11983 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tcp1P11983 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tcp1P11983 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tcp1P11983 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tcp1P11983 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tcp1P11983 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tcp1P11983 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tcp1P11983 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tcp1P11983 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tcp1P11983 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tcp1P11983 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tcp1P11983 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tcp1P11983 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tcp1P11983 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tcp1P11983 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tcp1P11983 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tcp1P11983 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tcp1P11983 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tcp1P11983 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tcp1P11983 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tcp1P11983 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tcp1P11983 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tcp1P11983 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tcp1P11983 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tcp1P11983 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcp1P11983 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcp1P11983 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcp1P11983 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tcp1P11983 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcp1P11983 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcp1P11983 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcp1P11983 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcp1P11983 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tcp1P11983 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tcp1P11983 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tcp1P11983 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tcp1P11983 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tcp1P11983 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tcp1P11983 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tcp1P11983 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tcp1P11983 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tcp1P11983 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tcp1P11983 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcp1P11983 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcp1P11983 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcp1P11983 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcp1P11983 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcp1P11983 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcp1P11983 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tcp1P11983 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tcp1P11983 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tcp1P11983 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tcp1P11983 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tcp1P11983 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tcp1P11983 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tcp1P11983 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tcp1P11983 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcp1P11983 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcp1P11983 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcp1P11983 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcp1P11983 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcp1P11983 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tcp1P11983 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tcp1P11983 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tcp1P11983 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcp1P11983 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcp1P11983 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcp1P11983 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcp1P11983 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcp1P11983 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcp1P11983 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcp1P11983 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcp1P11983 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcp1P11983 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcp1P11983 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcp1P11983 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcp1P11983 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcp1P11983 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tcp1P11983 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tcp1P11983 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tcp1P11983 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tcp1P11983 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tcp1P11983 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tcp1P11983 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcp1P11983 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcp1P11983 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcp1P11983 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcp1P11983 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcp1P11983 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcp1P11983 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcp1P11983 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcp1P11983 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcp1P11983 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcp1P11983 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms