Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnp2P11378 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnp2P11378 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnp2P11378 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnp2P11378 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnp2P11378 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnp2P11378 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnp2P11378 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnp2P11378 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnp2P11378 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnp2P11378 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnp2P11378 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnp2P11378 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnp2P11378 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnp2P11378 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnp2P11378 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnp2P11378 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnp2P11378 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnp2P11378 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms