Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd8bP10300 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd8bP10300 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd8bP10300 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd8bP10300 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd8bP10300 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd8bP10300 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd8bP10300 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd8bP10300 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd8bP10300 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd8bP10300 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd8bP10300 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd8bP10300 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd8bP10300 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd8bP10300 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd8bP10300 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd8bP10300 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd8bP10300 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd8bP10300 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd8bP10300 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd8bP10300 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd8bP10300 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd8bP10300 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd8bP10300 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd8bP10300 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd8bP10300 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd8bP10300 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd8bP10300 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd8bP10300 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd8bP10300 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd8bP10300 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd8bP10300 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd8bP10300 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd8bP10300 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd8bP10300 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd8bP10300 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd8bP10300 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd8bP10300 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd8bP10300 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd8bP10300 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd8bP10300 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd8bP10300 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd8bP10300 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd8bP10300 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd8bP10300 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd8bP10300 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd8bP10300 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd8bP10300 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd8bP10300 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd8bP10300 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd8bP10300 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd8bP10300 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd8bP10300 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd8bP10300 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd8bP10300 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cd8bP10300 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cd8bP10300 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cd8bP10300 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cd8bP10300 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd8bP10300 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd8bP10300 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd8bP10300 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd8bP10300 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd8bP10300 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd8bP10300 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd8bP10300 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd8bP10300 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd8bP10300 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cd8bP10300 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cd8bP10300 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cd8bP10300 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cd8bP10300 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd8bP10300 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd8bP10300 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd8bP10300 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd8bP10300 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cd8bP10300 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cd8bP10300 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cd8bP10300 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cd8bP10300 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd8bP10300 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd8bP10300 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd8bP10300 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd8bP10300 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd8bP10300 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd8bP10300 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd8bP10300 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd8bP10300 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cd8bP10300 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cd8bP10300 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cd8bP10300 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd8bP10300 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd8bP10300 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd8bP10300 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd8bP10300 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd8bP10300 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd8bP10300 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd8bP10300 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd8bP10300 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd8bP10300 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms