Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UbbP0CG49 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UbbP0CG49 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UbbP0CG49 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UbbP0CG49 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UbbP0CG49 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UbbP0CG49 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UbbP0CG49 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UbbP0CG49 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UbbP0CG49 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UbbP0CG49 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UbbP0CG49 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
UbbP0CG49 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UbbP0CG49 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UbbP0CG49 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UbbP0CG49 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UbbP0CG49 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UbbP0CG49 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UbbP0CG49 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UbbP0CG49 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UbbP0CG49 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UbbP0CG49 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UbbP0CG49 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UbbP0CG49 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UbbP0CG49 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UbbP0CG49 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UbbP0CG49 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UbbP0CG49 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UbbP0CG49 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UbbP0CG49 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UbbP0CG49 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UbbP0CG49 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UbbP0CG49 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UbbP0CG49 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UbbP0CG49 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UbbP0CG49 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UbbP0CG49 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UbbP0CG49 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UbbP0CG49 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UbbP0CG49 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UbbP0CG49 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
UbbP0CG49 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
UbbP0CG49 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UbbP0CG49 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UbbP0CG49 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UbbP0CG49 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UbbP0CG49 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UbbP0CG49 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UbbP0CG49 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UbbP0CG49 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UbbP0CG49 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UbbP0CG49 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UbbP0CG49 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UbbP0CG49 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UbbP0CG49 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UbbP0CG49 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UbbP0CG49 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UbbP0CG49 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UbbP0CG49 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UbbP0CG49 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
UbbP0CG49 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UbbP0CG49 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UbbP0CG49 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UbbP0CG49 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UbbP0CG49 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UbbP0CG49 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UbbP0CG49 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UbbP0CG49 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UbbP0CG49 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UbbP0CG49 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UbbP0CG49 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UbbP0CG49 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UbbP0CG49 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
UbbP0CG49 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UbbP0CG49 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UbbP0CG49 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.3 ms