Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igsf6P0C6B7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igsf6P0C6B7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igsf6P0C6B7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Igsf6P0C6B7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Igsf6P0C6B7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Igsf6P0C6B7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Igsf6P0C6B7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Igsf6P0C6B7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Igsf6P0C6B7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Igsf6P0C6B7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Igsf6P0C6B7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Igsf6P0C6B7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Igsf6P0C6B7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Igsf6P0C6B7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Igsf6P0C6B7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Igsf6P0C6B7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Igsf6P0C6B7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Igsf6P0C6B7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Igsf6P0C6B7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Igsf6P0C6B7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Igsf6P0C6B7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Igsf6P0C6B7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Igsf6P0C6B7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Igsf6P0C6B7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Igsf6P0C6B7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Igsf6P0C6B7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Igsf6P0C6B7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Igsf6P0C6B7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Igsf6P0C6B7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Igsf6P0C6B7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Igsf6P0C6B7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Igsf6P0C6B7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Igsf6P0C6B7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Igsf6P0C6B7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Igsf6P0C6B7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Igsf6P0C6B7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Igsf6P0C6B7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Igsf6P0C6B7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Igsf6P0C6B7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Igsf6P0C6B7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Igsf6P0C6B7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Igsf6P0C6B7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Igsf6P0C6B7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Igsf6P0C6B7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Igsf6P0C6B7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Igsf6P0C6B7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Igsf6P0C6B7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Igsf6P0C6B7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Igsf6P0C6B7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Igsf6P0C6B7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Igsf6P0C6B7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms