Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sbk3P0C5K0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sbk3P0C5K0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sbk3P0C5K0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sbk3P0C5K0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sbk3P0C5K0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sbk3P0C5K0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sbk3P0C5K0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sbk3P0C5K0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sbk3P0C5K0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sbk3P0C5K0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sbk3P0C5K0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sbk3P0C5K0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sbk3P0C5K0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sbk3P0C5K0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sbk3P0C5K0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sbk3P0C5K0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sbk3P0C5K0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sbk3P0C5K0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sbk3P0C5K0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sbk3P0C5K0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sbk3P0C5K0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sbk3P0C5K0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sbk3P0C5K0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sbk3P0C5K0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sbk3P0C5K0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sbk3P0C5K0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sbk3P0C5K0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sbk3P0C5K0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sbk3P0C5K0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sbk3P0C5K0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sbk3P0C5K0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sbk3P0C5K0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sbk3P0C5K0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sbk3P0C5K0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sbk3P0C5K0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sbk3P0C5K0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sbk3P0C5K0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbk3P0C5K0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbk3P0C5K0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sbk3P0C5K0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sbk3P0C5K0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sbk3P0C5K0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sbk3P0C5K0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sbk3P0C5K0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sbk3P0C5K0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbk3P0C5K0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbk3P0C5K0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbk3P0C5K0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbk3P0C5K0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbk3P0C5K0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbk3P0C5K0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbk3P0C5K0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbk3P0C5K0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbk3P0C5K0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbk3P0C5K0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbk3P0C5K0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbk3P0C5K0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbk3P0C5K0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbk3P0C5K0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbk3P0C5K0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sbk3P0C5K0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sbk3P0C5K0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbk3P0C5K0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbk3P0C5K0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbk3P0C5K0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbk3P0C5K0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbk3P0C5K0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbk3P0C5K0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbk3P0C5K0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbk3P0C5K0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbk3P0C5K0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbk3P0C5K0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbk3P0C5K0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbk3P0C5K0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbk3P0C5K0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbk3P0C5K0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbk3P0C5K0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbk3P0C5K0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbk3P0C5K0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbk3P0C5K0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbk3P0C5K0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sbk3P0C5K0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sbk3P0C5K0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbk3P0C5K0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbk3P0C5K0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbk3P0C5K0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sbk3P0C5K0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sbk3P0C5K0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbk3P0C5K0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbk3P0C5K0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sbk3P0C5K0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbk3P0C5K0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbk3P0C5K0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sbk3P0C5K0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sbk3P0C5K0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sbk3P0C5K0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sbk3P0C5K0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sbk3P0C5K0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sbk3P0C5K0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178 ms