Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ApoeP08226 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ApoeP08226 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ApoeP08226 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ApoeP08226 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ApoeP08226 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ApoeP08226 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ApoeP08226 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ApoeP08226 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ApoeP08226 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ApoeP08226 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ApoeP08226 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ApoeP08226 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ApoeP08226 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ApoeP08226 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApoeP08226 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApoeP08226 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApoeP08226 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ApoeP08226 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ApoeP08226 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ApoeP08226 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ApoeP08226 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ApoeP08226 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ApoeP08226 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ApoeP08226 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ApoeP08226 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ApoeP08226 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ApoeP08226 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ApoeP08226 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ApoeP08226 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ApoeP08226 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ApoeP08226 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ApoeP08226 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ApoeP08226 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ApoeP08226 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ApoeP08226 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ApoeP08226 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ApoeP08226 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ApoeP08226 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ApoeP08226 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ApoeP08226 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ApoeP08226 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ApoeP08226 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ApoeP08226 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ApoeP08226 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ApoeP08226 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ApoeP08226 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ApoeP08226 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ApoeP08226 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApoeP08226 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApoeP08226 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApoeP08226 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ApoeP08226 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ApoeP08226 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ApoeP08226 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ApoeP08226 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ApoeP08226 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ApoeP08226 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ApoeP08226 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ApoeP08226 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ApoeP08226 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApoeP08226 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApoeP08226 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApoeP08226 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApoeP08226 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApoeP08226 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApoeP08226 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApoeP08226 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ApoeP08226 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ApoeP08226 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ApoeP08226 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ApoeP08226 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ApoeP08226 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ApoeP08226 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ApoeP08226 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ApoeP08226 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ApoeP08226 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ApoeP08226 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ApoeP08226 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ApoeP08226 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ApoeP08226 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ApoeP08226 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ApoeP08226 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ApoeP08226 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ApoeP08226 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ApoeP08226 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ApoeP08226 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ApoeP08226 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ApoeP08226 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ApoeP08226 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ApoeP08226 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ApoeP08226 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ApoeP08226 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ApoeP08226 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ApoeP08226 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ApoeP08226 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ApoeP08226 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ApoeP08226 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApoeP08226 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApoeP08226 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.2 ms