Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01852 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01852 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01852 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01852 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01852 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
P01852 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01852 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01852 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01852 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01852 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01852 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01852 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01852 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01852 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01852 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01852 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01852 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01852 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01852 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01852 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01852 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01852 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01852 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01852 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01852 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01852 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01852 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01852 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01852 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01852 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01852 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01852 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01852 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01852 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01852 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
P01852 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01852 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01852 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01852 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01852 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01852 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01852 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01852 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01852 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01852 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01852 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01852 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01852 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01852 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01852 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
P01852 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01852 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01852 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01852 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01852 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01852 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01852 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01852 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01852 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01852 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01852 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01852 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
P01852 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01852 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01852 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01852 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01852 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01852 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01852 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01852 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01852 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01852 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01852 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01852 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01852 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01852 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01852 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01852 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01852 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01852 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01852 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01852 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
P01852 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
P01852 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01852 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
P01852 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01852 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01852 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01852 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01852 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
P01852 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01852 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01852 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01852 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01852 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01852 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01852 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01852 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01852 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms