Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CntfrO88507 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CntfrO88507 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CntfrO88507 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CntfrO88507 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CntfrO88507 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CntfrO88507 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CntfrO88507 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CntfrO88507 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CntfrO88507 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CntfrO88507 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CntfrO88507 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CntfrO88507 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CntfrO88507 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CntfrO88507 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CntfrO88507 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CntfrO88507 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CntfrO88507 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CntfrO88507 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CntfrO88507 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CntfrO88507 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CntfrO88507 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CntfrO88507 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CntfrO88507 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CntfrO88507 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CntfrO88507 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CntfrO88507 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CntfrO88507 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CntfrO88507 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CntfrO88507 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CntfrO88507 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CntfrO88507 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CntfrO88507 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CntfrO88507 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CntfrO88507 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CntfrO88507 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CntfrO88507 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CntfrO88507 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CntfrO88507 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CntfrO88507 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CntfrO88507 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CntfrO88507 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CntfrO88507 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CntfrO88507 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CntfrO88507 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CntfrO88507 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CntfrO88507 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CntfrO88507 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CntfrO88507 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CntfrO88507 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CntfrO88507 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CntfrO88507 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CntfrO88507 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CntfrO88507 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CntfrO88507 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CntfrO88507 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CntfrO88507 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CntfrO88507 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CntfrO88507 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CntfrO88507 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CntfrO88507 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CntfrO88507 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CntfrO88507 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CntfrO88507 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CntfrO88507 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CntfrO88507 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CntfrO88507 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CntfrO88507 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CntfrO88507 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CntfrO88507 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CntfrO88507 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CntfrO88507 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CntfrO88507 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CntfrO88507 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CntfrO88507 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CntfrO88507 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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