Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capns1O88456 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capns1O88456 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capns1O88456 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capns1O88456 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capns1O88456 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capns1O88456 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capns1O88456 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Capns1O88456 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capns1O88456 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Capns1O88456 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capns1O88456 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capns1O88456 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capns1O88456 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capns1O88456 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Capns1O88456 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capns1O88456 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capns1O88456 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capns1O88456 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capns1O88456 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capns1O88456 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capns1O88456 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capns1O88456 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capns1O88456 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capns1O88456 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capns1O88456 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capns1O88456 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capns1O88456 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capns1O88456 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capns1O88456 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capns1O88456 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capns1O88456 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capns1O88456 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capns1O88456 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capns1O88456 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Capns1O88456 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capns1O88456 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capns1O88456 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capns1O88456 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capns1O88456 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capns1O88456 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Capns1O88456 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Capns1O88456 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capns1O88456 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capns1O88456 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capns1O88456 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capns1O88456 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capns1O88456 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capns1O88456 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capns1O88456 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capns1O88456 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Capns1O88456 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capns1O88456 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capns1O88456 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capns1O88456 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capns1O88456 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capns1O88456 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capns1O88456 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Capns1O88456 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capns1O88456 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capns1O88456 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capns1O88456 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capns1O88456 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capns1O88456 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capns1O88456 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Capns1O88456 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capns1O88456 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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