Protein–RNA interactions for Protein: O88324

Cd83, CD83 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd83O88324 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd83O88324 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd83O88324 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd83O88324 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd83O88324 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd83O88324 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd83O88324 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd83O88324 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd83O88324 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd83O88324 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd83O88324 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd83O88324 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd83O88324 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd83O88324 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd83O88324 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd83O88324 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd83O88324 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd83O88324 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd83O88324 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd83O88324 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd83O88324 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd83O88324 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd83O88324 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd83O88324 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd83O88324 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd83O88324 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd83O88324 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd83O88324 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd83O88324 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd83O88324 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd83O88324 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd83O88324 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd83O88324 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd83O88324 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd83O88324 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd83O88324 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd83O88324 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd83O88324 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd83O88324 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd83O88324 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd83O88324 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd83O88324 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd83O88324 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd83O88324 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd83O88324 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd83O88324 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd83O88324 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd83O88324 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd83O88324 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd83O88324 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd83O88324 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd83O88324 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd83O88324 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd83O88324 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd83O88324 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd83O88324 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cd83O88324 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cd83O88324 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cd83O88324 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd83O88324 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cd83O88324 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd83O88324 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd83O88324 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cd83O88324 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd83O88324 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd83O88324 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd83O88324 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd83O88324 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd83O88324 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd83O88324 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd83O88324 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd83O88324 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd83O88324 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd83O88324 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd83O88324 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd83O88324 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd83O88324 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd83O88324 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.9 ms