Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mid1O70583 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mid1O70583 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mid1O70583 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mid1O70583 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mid1O70583 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mid1O70583 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mid1O70583 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mid1O70583 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mid1O70583 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mid1O70583 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mid1O70583 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mid1O70583 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mid1O70583 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mid1O70583 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Mid1O70583 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mid1O70583 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mid1O70583 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mid1O70583 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mid1O70583 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mid1O70583 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mid1O70583 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mid1O70583 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mid1O70583 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mid1O70583 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Mid1O70583 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mid1O70583 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mid1O70583 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mid1O70583 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mid1O70583 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mid1O70583 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mid1O70583 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mid1O70583 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mid1O70583 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mid1O70583 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mid1O70583 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mid1O70583 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mid1O70583 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mid1O70583 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mid1O70583 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mid1O70583 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mid1O70583 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mid1O70583 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mid1O70583 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mid1O70583 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mid1O70583 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mid1O70583 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mid1O70583 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mid1O70583 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mid1O70583 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mid1O70583 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Mid1O70583 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mid1O70583 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mid1O70583 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mid1O70583 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mid1O70583 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mid1O70583 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mid1O70583 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mid1O70583 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mid1O70583 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Mid1O70583 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mid1O70583 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mid1O70583 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mid1O70583 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Mid1O70583 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mid1O70583 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mid1O70583 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mid1O70583 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mid1O70583 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mid1O70583 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mid1O70583 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mid1O70583 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mid1O70583 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mid1O70583 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mid1O70583 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mid1O70583 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mid1O70583 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mid1O70583 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mid1O70583 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mid1O70583 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mid1O70583 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mid1O70583 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mid1O70583 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mid1O70583 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mid1O70583 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mid1O70583 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mid1O70583 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mid1O70583 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mid1O70583 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mid1O70583 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Mid1O70583 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mid1O70583 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mid1O70583 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mid1O70583 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mid1O70583 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mid1O70583 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mid1O70583 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mid1O70583 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mid1O70583 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mid1O70583 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms