Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PrxO55103 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PrxO55103 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PrxO55103 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PrxO55103 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PrxO55103 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PrxO55103 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PrxO55103 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PrxO55103 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PrxO55103 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PrxO55103 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PrxO55103 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PrxO55103 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PrxO55103 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PrxO55103 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PrxO55103 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PrxO55103 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PrxO55103 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PrxO55103 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PrxO55103 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PrxO55103 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PrxO55103 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PrxO55103 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PrxO55103 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PrxO55103 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PrxO55103 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PrxO55103 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PrxO55103 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PrxO55103 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PrxO55103 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PrxO55103 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PrxO55103 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PrxO55103 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PrxO55103 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PrxO55103 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
PrxO55103 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PrxO55103 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PrxO55103 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PrxO55103 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PrxO55103 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PrxO55103 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PrxO55103 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PrxO55103 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PrxO55103 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
PrxO55103 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PrxO55103 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PrxO55103 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PrxO55103 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PrxO55103 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PrxO55103 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PrxO55103 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PrxO55103 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PrxO55103 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PrxO55103 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PrxO55103 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PrxO55103 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PrxO55103 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PrxO55103 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
PrxO55103 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PrxO55103 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PrxO55103 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PrxO55103 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PrxO55103 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PrxO55103 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PrxO55103 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PrxO55103 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PrxO55103 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PrxO55103 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PrxO55103 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
PrxO55103 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PrxO55103 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PrxO55103 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
PrxO55103 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PrxO55103 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PrxO55103 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PrxO55103 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PrxO55103 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PrxO55103 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PrxO55103 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PrxO55103 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PrxO55103 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PrxO55103 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PrxO55103 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PrxO55103 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PrxO55103 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
PrxO55103 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PrxO55103 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PrxO55103 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PrxO55103 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PrxO55103 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PrxO55103 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PrxO55103 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PrxO55103 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PrxO55103 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PrxO55103 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PrxO55103 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PrxO55103 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
PrxO55103 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PrxO55103 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PrxO55103 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms