Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syngr2O55101 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syngr2O55101 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syngr2O55101 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syngr2O55101 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngr2O55101 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngr2O55101 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngr2O55101 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngr2O55101 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngr2O55101 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngr2O55101 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngr2O55101 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngr2O55101 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngr2O55101 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngr2O55101 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngr2O55101 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syngr2O55101 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr2O55101 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr2O55101 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syngr2O55101 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syngr2O55101 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syngr2O55101 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr2O55101 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr2O55101 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr2O55101 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr2O55101 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngr2O55101 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngr2O55101 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngr2O55101 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngr2O55101 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr2O55101 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr2O55101 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr2O55101 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr2O55101 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngr2O55101 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngr2O55101 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngr2O55101 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngr2O55101 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syngr2O55101 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syngr2O55101 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Syngr2O55101 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngr2O55101 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngr2O55101 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngr2O55101 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngr2O55101 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngr2O55101 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngr2O55101 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngr2O55101 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngr2O55101 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngr2O55101 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngr2O55101 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngr2O55101 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syngr2O55101 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syngr2O55101 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syngr2O55101 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syngr2O55101 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syngr2O55101 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syngr2O55101 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syngr2O55101 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syngr2O55101 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syngr2O55101 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syngr2O55101 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngr2O55101 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngr2O55101 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngr2O55101 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngr2O55101 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngr2O55101 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngr2O55101 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngr2O55101 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngr2O55101 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr2O55101 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr2O55101 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr2O55101 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr2O55101 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr2O55101 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr2O55101 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr2O55101 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr2O55101 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngr2O55101 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngr2O55101 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngr2O55101 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Syngr2O55101 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngr2O55101 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngr2O55101 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngr2O55101 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngr2O55101 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngr2O55101 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngr2O55101 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngr2O55101 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngr2O55101 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngr2O55101 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngr2O55101 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngr2O55101 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngr2O55101 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngr2O55101 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngr2O55101 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngr2O55101 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngr2O55101 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngr2O55101 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngr2O55101 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms