Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LatO54957 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LatO54957 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LatO54957 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LatO54957 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LatO54957 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LatO54957 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LatO54957 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LatO54957 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LatO54957 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LatO54957 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LatO54957 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LatO54957 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LatO54957 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LatO54957 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LatO54957 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LatO54957 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LatO54957 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LatO54957 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LatO54957 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LatO54957 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LatO54957 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LatO54957 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LatO54957 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LatO54957 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LatO54957 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LatO54957 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LatO54957 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LatO54957 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LatO54957 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LatO54957 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LatO54957 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LatO54957 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LatO54957 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LatO54957 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LatO54957 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LatO54957 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LatO54957 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LatO54957 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LatO54957 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LatO54957 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LatO54957 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LatO54957 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LatO54957 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LatO54957 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LatO54957 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LatO54957 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LatO54957 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LatO54957 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LatO54957 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LatO54957 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LatO54957 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LatO54957 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LatO54957 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LatO54957 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LatO54957 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LatO54957 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LatO54957 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LatO54957 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LatO54957 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LatO54957 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LatO54957 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LatO54957 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LatO54957 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LatO54957 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LatO54957 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LatO54957 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LatO54957 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LatO54957 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LatO54957 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LatO54957 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LatO54957 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LatO54957 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LatO54957 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LatO54957 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LatO54957 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LatO54957 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LatO54957 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LatO54957 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LatO54957 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LatO54957 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LatO54957 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LatO54957 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LatO54957 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LatO54957 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LatO54957 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LatO54957 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LatO54957 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LatO54957 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LatO54957 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LatO54957 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LatO54957 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LatO54957 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LatO54957 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LatO54957 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LatO54957 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LatO54957 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LatO54957 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LatO54957 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LatO54957 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms