Protein–RNA interactions for Protein: O54915

Nr1i2, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1i2O54915 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nr1i2O54915 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nr1i2O54915 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nr1i2O54915 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Nr1i2O54915 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nr1i2O54915 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nr1i2O54915 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nr1i2O54915 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Nr1i2O54915 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nr1i2O54915 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nr1i2O54915 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nr1i2O54915 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nr1i2O54915 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nr1i2O54915 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nr1i2O54915 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nr1i2O54915 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nr1i2O54915 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nr1i2O54915 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nr1i2O54915 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nr1i2O54915 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nr1i2O54915 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nr1i2O54915 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nr1i2O54915 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nr1i2O54915 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nr1i2O54915 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nr1i2O54915 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nr1i2O54915 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nr1i2O54915 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nr1i2O54915 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nr1i2O54915 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Nr1i2O54915 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nr1i2O54915 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nr1i2O54915 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nr1i2O54915 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Nr1i2O54915 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nr1i2O54915 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nr1i2O54915 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Nr1i2O54915 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nr1i2O54915 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nr1i2O54915 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nr1i2O54915 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nr1i2O54915 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nr1i2O54915 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nr1i2O54915 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nr1i2O54915 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nr1i2O54915 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nr1i2O54915 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nr1i2O54915 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nr1i2O54915 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nr1i2O54915 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nr1i2O54915 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nr1i2O54915 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nr1i2O54915 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nr1i2O54915 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nr1i2O54915 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nr1i2O54915 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nr1i2O54915 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nr1i2O54915 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nr1i2O54915 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nr1i2O54915 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nr1i2O54915 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nr1i2O54915 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nr1i2O54915 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nr1i2O54915 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nr1i2O54915 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nr1i2O54915 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nr1i2O54915 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Nr1i2O54915 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nr1i2O54915 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nr1i2O54915 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nr1i2O54915 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nr1i2O54915 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nr1i2O54915 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nr1i2O54915 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nr1i2O54915 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nr1i2O54915 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nr1i2O54915 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nr1i2O54915 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nr1i2O54915 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nr1i2O54915 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nr1i2O54915 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nr1i2O54915 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nr1i2O54915 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nr1i2O54915 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nr1i2O54915 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nr1i2O54915 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nr1i2O54915 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nr1i2O54915 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nr1i2O54915 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nr1i2O54915 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nr1i2O54915 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nr1i2O54915 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nr1i2O54915 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nr1i2O54915 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nr1i2O54915 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nr1i2O54915 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nr1i2O54915 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nr1i2O54915 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nr1i2O54915 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nr1i2O54915 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms