Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh16O54909 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh16O54909 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh16O54909 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh16O54909 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh16O54909 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh16O54909 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh16O54909 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh16O54909 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh16O54909 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rdh16O54909 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rdh16O54909 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh16O54909 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh16O54909 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh16O54909 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh16O54909 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh16O54909 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh16O54909 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh16O54909 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh16O54909 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh16O54909 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rdh16O54909 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rdh16O54909 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rdh16O54909 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh16O54909 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh16O54909 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh16O54909 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh16O54909 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh16O54909 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh16O54909 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rdh16O54909 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rdh16O54909 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rdh16O54909 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh16O54909 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh16O54909 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh16O54909 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh16O54909 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh16O54909 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh16O54909 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh16O54909 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh16O54909 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh16O54909 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh16O54909 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh16O54909 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh16O54909 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh16O54909 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh16O54909 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh16O54909 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh16O54909 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh16O54909 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh16O54909 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh16O54909 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh16O54909 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh16O54909 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh16O54909 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh16O54909 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh16O54909 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh16O54909 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh16O54909 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh16O54909 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh16O54909 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh16O54909 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh16O54909 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh16O54909 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh16O54909 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh16O54909 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh16O54909 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh16O54909 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh16O54909 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh16O54909 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh16O54909 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh16O54909 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdh16O54909 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdh16O54909 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdh16O54909 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdh16O54909 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdh16O54909 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdh16O54909 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdh16O54909 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdh16O54909 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh16O54909 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh16O54909 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh16O54909 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh16O54909 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh16O54909 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh16O54909 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh16O54909 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh16O54909 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh16O54909 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh16O54909 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdh16O54909 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdh16O54909 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdh16O54909 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdh16O54909 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdh16O54909 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdh16O54909 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rdh16O54909 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rdh16O54909 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rdh16O54909 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rdh16O54909 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms