Protein–RNA interactions for Protein: O35954

Pitpnm1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm1O35954 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pitpnm1O35954 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pitpnm1O35954 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pitpnm1O35954 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pitpnm1O35954 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pitpnm1O35954 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pitpnm1O35954 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pitpnm1O35954 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Pitpnm1O35954 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pitpnm1O35954 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pitpnm1O35954 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pitpnm1O35954 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Pitpnm1O35954 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pitpnm1O35954 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pitpnm1O35954 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pitpnm1O35954 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pitpnm1O35954 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pitpnm1O35954 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Pitpnm1O35954 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pitpnm1O35954 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pitpnm1O35954 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pitpnm1O35954 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pitpnm1O35954 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pitpnm1O35954 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pitpnm1O35954 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pitpnm1O35954 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pitpnm1O35954 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pitpnm1O35954 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pitpnm1O35954 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pitpnm1O35954 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pitpnm1O35954 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pitpnm1O35954 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pitpnm1O35954 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pitpnm1O35954 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Pitpnm1O35954 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pitpnm1O35954 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pitpnm1O35954 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pitpnm1O35954 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pitpnm1O35954 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pitpnm1O35954 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pitpnm1O35954 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Pitpnm1O35954 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pitpnm1O35954 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pitpnm1O35954 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pitpnm1O35954 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pitpnm1O35954 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pitpnm1O35954 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pitpnm1O35954 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pitpnm1O35954 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Pitpnm1O35954 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pitpnm1O35954 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pitpnm1O35954 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pitpnm1O35954 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pitpnm1O35954 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pitpnm1O35954 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pitpnm1O35954 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pitpnm1O35954 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pitpnm1O35954 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pitpnm1O35954 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pitpnm1O35954 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pitpnm1O35954 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Pitpnm1O35954 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pitpnm1O35954 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pitpnm1O35954 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pitpnm1O35954 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pitpnm1O35954 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pitpnm1O35954 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pitpnm1O35954 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pitpnm1O35954 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pitpnm1O35954 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pitpnm1O35954 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Pitpnm1O35954 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pitpnm1O35954 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pitpnm1O35954 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pitpnm1O35954 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pitpnm1O35954 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pitpnm1O35954 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pitpnm1O35954 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pitpnm1O35954 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pitpnm1O35954 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pitpnm1O35954 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pitpnm1O35954 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pitpnm1O35954 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pitpnm1O35954 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pitpnm1O35954 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pitpnm1O35954 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pitpnm1O35954 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pitpnm1O35954 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pitpnm1O35954 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pitpnm1O35954 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pitpnm1O35954 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pitpnm1O35954 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pitpnm1O35954 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pitpnm1O35954 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pitpnm1O35954 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pitpnm1O35954 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pitpnm1O35954 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Pitpnm1O35954 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pitpnm1O35954 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pitpnm1O35954 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms