Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FxnO35943 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FxnO35943 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FxnO35943 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FxnO35943 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FxnO35943 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FxnO35943 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FxnO35943 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FxnO35943 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FxnO35943 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FxnO35943 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FxnO35943 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FxnO35943 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FxnO35943 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FxnO35943 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FxnO35943 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FxnO35943 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FxnO35943 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FxnO35943 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FxnO35943 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FxnO35943 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FxnO35943 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FxnO35943 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FxnO35943 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FxnO35943 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FxnO35943 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FxnO35943 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FxnO35943 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FxnO35943 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FxnO35943 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FxnO35943 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FxnO35943 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FxnO35943 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FxnO35943 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FxnO35943 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FxnO35943 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FxnO35943 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FxnO35943 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FxnO35943 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FxnO35943 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FxnO35943 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FxnO35943 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FxnO35943 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FxnO35943 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FxnO35943 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FxnO35943 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FxnO35943 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FxnO35943 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FxnO35943 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FxnO35943 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FxnO35943 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FxnO35943 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FxnO35943 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FxnO35943 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FxnO35943 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FxnO35943 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FxnO35943 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FxnO35943 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FxnO35943 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FxnO35943 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FxnO35943 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FxnO35943 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FxnO35943 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FxnO35943 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FxnO35943 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FxnO35943 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FxnO35943 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FxnO35943 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FxnO35943 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FxnO35943 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FxnO35943 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FxnO35943 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FxnO35943 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FxnO35943 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FxnO35943 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FxnO35943 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FxnO35943 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FxnO35943 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FxnO35943 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FxnO35943 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FxnO35943 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FxnO35943 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FxnO35943 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FxnO35943 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FxnO35943 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FxnO35943 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FxnO35943 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FxnO35943 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FxnO35943 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FxnO35943 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FxnO35943 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FxnO35943 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FxnO35943 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FxnO35943 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FxnO35943 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FxnO35943 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FxnO35943 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FxnO35943 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FxnO35943 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FxnO35943 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms