Protein–RNA interactions for Protein: O35609

Scamp3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp3O35609 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scamp3O35609 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scamp3O35609 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scamp3O35609 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scamp3O35609 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scamp3O35609 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scamp3O35609 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scamp3O35609 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scamp3O35609 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Scamp3O35609 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Scamp3O35609 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scamp3O35609 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scamp3O35609 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scamp3O35609 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scamp3O35609 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scamp3O35609 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scamp3O35609 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scamp3O35609 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scamp3O35609 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Scamp3O35609 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scamp3O35609 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scamp3O35609 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scamp3O35609 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Scamp3O35609 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scamp3O35609 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scamp3O35609 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scamp3O35609 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scamp3O35609 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scamp3O35609 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scamp3O35609 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Scamp3O35609 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scamp3O35609 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scamp3O35609 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scamp3O35609 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scamp3O35609 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scamp3O35609 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scamp3O35609 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scamp3O35609 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scamp3O35609 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scamp3O35609 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Scamp3O35609 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scamp3O35609 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scamp3O35609 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scamp3O35609 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scamp3O35609 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scamp3O35609 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scamp3O35609 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scamp3O35609 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scamp3O35609 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scamp3O35609 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scamp3O35609 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scamp3O35609 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scamp3O35609 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scamp3O35609 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scamp3O35609 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scamp3O35609 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Scamp3O35609 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scamp3O35609 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Scamp3O35609 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Scamp3O35609 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scamp3O35609 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scamp3O35609 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scamp3O35609 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scamp3O35609 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scamp3O35609 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scamp3O35609 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scamp3O35609 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scamp3O35609 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scamp3O35609 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scamp3O35609 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scamp3O35609 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scamp3O35609 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scamp3O35609 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scamp3O35609 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scamp3O35609 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scamp3O35609 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scamp3O35609 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scamp3O35609 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scamp3O35609 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scamp3O35609 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scamp3O35609 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scamp3O35609 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scamp3O35609 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scamp3O35609 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scamp3O35609 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scamp3O35609 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Scamp3O35609 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scamp3O35609 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scamp3O35609 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scamp3O35609 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scamp3O35609 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scamp3O35609 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scamp3O35609 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scamp3O35609 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scamp3O35609 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scamp3O35609 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scamp3O35609 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scamp3O35609 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scamp3O35609 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scamp3O35609 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms