Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pitx3O35160 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pitx3O35160 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pitx3O35160 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pitx3O35160 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pitx3O35160 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pitx3O35160 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pitx3O35160 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pitx3O35160 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pitx3O35160 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pitx3O35160 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pitx3O35160 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pitx3O35160 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pitx3O35160 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pitx3O35160 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pitx3O35160 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pitx3O35160 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pitx3O35160 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pitx3O35160 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pitx3O35160 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pitx3O35160 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pitx3O35160 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pitx3O35160 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pitx3O35160 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pitx3O35160 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pitx3O35160 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pitx3O35160 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pitx3O35160 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pitx3O35160 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pitx3O35160 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pitx3O35160 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pitx3O35160 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pitx3O35160 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pitx3O35160 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pitx3O35160 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pitx3O35160 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pitx3O35160 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pitx3O35160 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pitx3O35160 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pitx3O35160 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pitx3O35160 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pitx3O35160 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pitx3O35160 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pitx3O35160 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pitx3O35160 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pitx3O35160 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pitx3O35160 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pitx3O35160 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pitx3O35160 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pitx3O35160 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pitx3O35160 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms