Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc23O35125 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc23O35125 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc23O35125 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc23O35125 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc23O35125 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc23O35125 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc23O35125 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc23O35125 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc23O35125 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc23O35125 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc23O35125 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc23O35125 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc23O35125 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc23O35125 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc23O35125 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc23O35125 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc23O35125 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc23O35125 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc23O35125 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc23O35125 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc23O35125 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc23O35125 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc23O35125 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc23O35125 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc23O35125 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc23O35125 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc23O35125 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc23O35125 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc23O35125 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc23O35125 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc23O35125 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc23O35125 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc23O35125 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc23O35125 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc23O35125 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc23O35125 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc23O35125 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc23O35125 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc23O35125 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc23O35125 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc23O35125 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc23O35125 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc23O35125 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc23O35125 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc23O35125 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc23O35125 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc23O35125 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc23O35125 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc23O35125 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc23O35125 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc23O35125 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc23O35125 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc23O35125 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc23O35125 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc23O35125 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc23O35125 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc23O35125 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc23O35125 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc23O35125 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc23O35125 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc23O35125 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc23O35125 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc23O35125 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc23O35125 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc23O35125 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc23O35125 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc23O35125 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc23O35125 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc23O35125 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc23O35125 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc23O35125 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc23O35125 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc23O35125 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc23O35125 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc23O35125 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc23O35125 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc23O35125 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc23O35125 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc23O35125 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc23O35125 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc23O35125 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc23O35125 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc23O35125 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc23O35125 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc23O35125 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc23O35125 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc23O35125 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc23O35125 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc23O35125 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc23O35125 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc23O35125 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc23O35125 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc23O35125 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc23O35125 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc23O35125 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc23O35125 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc23O35125 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc23O35125 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc23O35125 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms