Protein–RNA interactions for Protein: O09164

Sod3, Extracellular superoxide dismutase [Cu-Zn], mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sod3O09164 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sod3O09164 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sod3O09164 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sod3O09164 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sod3O09164 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sod3O09164 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sod3O09164 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sod3O09164 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sod3O09164 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sod3O09164 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sod3O09164 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sod3O09164 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sod3O09164 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sod3O09164 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sod3O09164 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sod3O09164 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sod3O09164 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sod3O09164 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sod3O09164 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sod3O09164 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sod3O09164 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sod3O09164 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sod3O09164 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sod3O09164 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sod3O09164 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sod3O09164 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sod3O09164 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sod3O09164 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sod3O09164 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sod3O09164 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sod3O09164 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sod3O09164 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sod3O09164 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sod3O09164 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sod3O09164 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sod3O09164 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sod3O09164 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sod3O09164 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sod3O09164 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sod3O09164 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sod3O09164 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sod3O09164 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sod3O09164 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sod3O09164 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sod3O09164 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sod3O09164 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sod3O09164 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sod3O09164 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sod3O09164 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sod3O09164 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sod3O09164 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sod3O09164 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sod3O09164 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sod3O09164 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sod3O09164 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sod3O09164 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sod3O09164 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sod3O09164 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sod3O09164 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sod3O09164 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sod3O09164 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sod3O09164 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sod3O09164 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sod3O09164 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sod3O09164 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sod3O09164 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sod3O09164 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sod3O09164 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sod3O09164 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sod3O09164 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sod3O09164 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sod3O09164 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sod3O09164 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sod3O09164 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sod3O09164 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sod3O09164 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sod3O09164 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sod3O09164 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sod3O09164 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sod3O09164 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sod3O09164 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sod3O09164 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sod3O09164 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sod3O09164 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sod3O09164 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sod3O09164 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sod3O09164 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sod3O09164 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sod3O09164 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sod3O09164 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sod3O09164 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sod3O09164 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sod3O09164 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sod3O09164 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sod3O09164 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sod3O09164 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sod3O09164 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sod3O09164 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sod3O09164 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sod3O09164 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.9 ms