Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hdac1O09106 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hdac1O09106 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hdac1O09106 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hdac1O09106 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hdac1O09106 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hdac1O09106 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hdac1O09106 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hdac1O09106 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hdac1O09106 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hdac1O09106 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hdac1O09106 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hdac1O09106 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hdac1O09106 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hdac1O09106 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hdac1O09106 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hdac1O09106 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hdac1O09106 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hdac1O09106 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hdac1O09106 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hdac1O09106 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hdac1O09106 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hdac1O09106 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hdac1O09106 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hdac1O09106 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hdac1O09106 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hdac1O09106 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hdac1O09106 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Hdac1O09106 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hdac1O09106 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hdac1O09106 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hdac1O09106 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hdac1O09106 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hdac1O09106 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hdac1O09106 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hdac1O09106 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hdac1O09106 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hdac1O09106 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hdac1O09106 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hdac1O09106 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hdac1O09106 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hdac1O09106 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hdac1O09106 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hdac1O09106 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hdac1O09106 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hdac1O09106 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hdac1O09106 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hdac1O09106 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hdac1O09106 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hdac1O09106 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hdac1O09106 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hdac1O09106 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hdac1O09106 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hdac1O09106 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hdac1O09106 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hdac1O09106 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Hdac1O09106 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hdac1O09106 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Hdac1O09106 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hdac1O09106 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hdac1O09106 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hdac1O09106 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hdac1O09106 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hdac1O09106 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hdac1O09106 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hdac1O09106 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Hdac1O09106 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hdac1O09106 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hdac1O09106 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hdac1O09106 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hdac1O09106 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Hdac1O09106 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hdac1O09106 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hdac1O09106 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hdac1O09106 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hdac1O09106 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hdac1O09106 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hdac1O09106 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hdac1O09106 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hdac1O09106 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Hdac1O09106 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hdac1O09106 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hdac1O09106 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hdac1O09106 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hdac1O09106 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hdac1O09106 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hdac1O09106 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hdac1O09106 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hdac1O09106 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hdac1O09106 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hdac1O09106 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hdac1O09106 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hdac1O09106 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hdac1O09106 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hdac1O09106 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hdac1O09106 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hdac1O09106 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hdac1O09106 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hdac1O09106 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hdac1O09106 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms