Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClockO08785 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClockO08785 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClockO08785 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClockO08785 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClockO08785 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClockO08785 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClockO08785 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClockO08785 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClockO08785 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClockO08785 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ClockO08785 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ClockO08785 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ClockO08785 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClockO08785 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClockO08785 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClockO08785 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClockO08785 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClockO08785 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ClockO08785 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClockO08785 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClockO08785 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClockO08785 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClockO08785 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClockO08785 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClockO08785 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClockO08785 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClockO08785 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClockO08785 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClockO08785 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClockO08785 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClockO08785 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClockO08785 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClockO08785 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClockO08785 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClockO08785 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClockO08785 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ClockO08785 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClockO08785 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClockO08785 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClockO08785 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClockO08785 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClockO08785 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClockO08785 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClockO08785 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClockO08785 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClockO08785 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ClockO08785 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ClockO08785 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClockO08785 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClockO08785 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClockO08785 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClockO08785 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClockO08785 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClockO08785 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClockO08785 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClockO08785 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClockO08785 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClockO08785 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClockO08785 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClockO08785 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClockO08785 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ClockO08785 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ClockO08785 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ClockO08785 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ClockO08785 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClockO08785 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClockO08785 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClockO08785 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClockO08785 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClockO08785 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ClockO08785 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ClockO08785 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClockO08785 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClockO08785 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClockO08785 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClockO08785 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClockO08785 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClockO08785 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClockO08785 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClockO08785 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClockO08785 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClockO08785 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClockO08785 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ClockO08785 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClockO08785 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClockO08785 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClockO08785 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClockO08785 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClockO08785 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClockO08785 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClockO08785 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClockO08785 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClockO08785 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ClockO08785 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClockO08785 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClockO08785 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClockO08785 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClockO08785 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClockO08785 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 238.8 ms