Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tcof1O08784 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tcof1O08784 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tcof1O08784 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tcof1O08784 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tcof1O08784 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tcof1O08784 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tcof1O08784 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tcof1O08784 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tcof1O08784 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tcof1O08784 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Tcof1O08784 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tcof1O08784 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tcof1O08784 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Tcof1O08784 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tcof1O08784 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tcof1O08784 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tcof1O08784 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tcof1O08784 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tcof1O08784 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tcof1O08784 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tcof1O08784 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tcof1O08784 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tcof1O08784 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tcof1O08784 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tcof1O08784 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tcof1O08784 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tcof1O08784 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tcof1O08784 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tcof1O08784 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tcof1O08784 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Tcof1O08784 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tcof1O08784 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tcof1O08784 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Tcof1O08784 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tcof1O08784 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tcof1O08784 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tcof1O08784 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tcof1O08784 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tcof1O08784 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tcof1O08784 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tcof1O08784 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tcof1O08784 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tcof1O08784 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tcof1O08784 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tcof1O08784 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tcof1O08784 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tcof1O08784 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tcof1O08784 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tcof1O08784 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tcof1O08784 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Tcof1O08784 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tcof1O08784 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tcof1O08784 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tcof1O08784 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Tcof1O08784 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tcof1O08784 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tcof1O08784 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tcof1O08784 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tcof1O08784 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tcof1O08784 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tcof1O08784 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tcof1O08784 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tcof1O08784 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Tcof1O08784 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Tcof1O08784 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Tcof1O08784 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tcof1O08784 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tcof1O08784 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Tcof1O08784 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Tcof1O08784 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tcof1O08784 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tcof1O08784 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tcof1O08784 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tcof1O08784 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tcof1O08784 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tcof1O08784 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tcof1O08784 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tcof1O08784 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tcof1O08784 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tcof1O08784 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tcof1O08784 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tcof1O08784 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tcof1O08784 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tcof1O08784 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tcof1O08784 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tcof1O08784 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tcof1O08784 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tcof1O08784 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tcof1O08784 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tcof1O08784 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tcof1O08784 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tcof1O08784 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tcof1O08784 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tcof1O08784 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tcof1O08784 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tcof1O08784 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tcof1O08784 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tcof1O08784 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tcof1O08784 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms