Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3542K7N6U2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3542K7N6U2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3542K7N6U2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3542K7N6U2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3542K7N6U2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3542K7N6U2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3542K7N6U2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3542K7N6U2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3542K7N6U2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3542K7N6U2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3542K7N6U2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3542K7N6U2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3542K7N6U2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3542K7N6U2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3542K7N6U2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3542K7N6U2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3542K7N6U2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3542K7N6U2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3542K7N6U2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3542K7N6U2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3542K7N6U2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3542K7N6U2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3542K7N6U2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3542K7N6U2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3542K7N6U2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3542K7N6U2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3542K7N6U2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3542K7N6U2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3542K7N6U2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3542K7N6U2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3542K7N6U2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3542K7N6U2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3542K7N6U2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3542K7N6U2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3542K7N6U2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3542K7N6U2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3542K7N6U2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3542K7N6U2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3542K7N6U2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3542K7N6U2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3542K7N6U2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3542K7N6U2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3542K7N6U2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3542K7N6U2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3542K7N6U2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3542K7N6U2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3542K7N6U2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3542K7N6U2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3542K7N6U2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3542K7N6U2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3542K7N6U2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3542K7N6U2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3542K7N6U2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3542K7N6U2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3542K7N6U2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3542K7N6U2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3542K7N6U2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3542K7N6U2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3542K7N6U2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3542K7N6U2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3542K7N6U2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3542K7N6U2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3542K7N6U2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3542K7N6U2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3542K7N6U2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3542K7N6U2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3542K7N6U2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3542K7N6U2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3542K7N6U2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3542K7N6U2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3542K7N6U2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3542K7N6U2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3542K7N6U2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3542K7N6U2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3542K7N6U2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3542K7N6U2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3542K7N6U2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3542K7N6U2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3542K7N6U2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3542K7N6U2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3542K7N6U2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3542K7N6U2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3542K7N6U2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3542K7N6U2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3542K7N6U2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3542K7N6U2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3542K7N6U2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gm3542K7N6U2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3542K7N6U2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3542K7N6U2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3542K7N6U2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3542K7N6U2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3542K7N6U2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3542K7N6U2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3542K7N6U2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3542K7N6U2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3542K7N6U2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3542K7N6U2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3542K7N6U2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms