Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ5

Cfap73, Cilia- and flagella-associated protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap73J3QPZ5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cfap73J3QPZ5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cfap73J3QPZ5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cfap73J3QPZ5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cfap73J3QPZ5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cfap73J3QPZ5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cfap73J3QPZ5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cfap73J3QPZ5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cfap73J3QPZ5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cfap73J3QPZ5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cfap73J3QPZ5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cfap73J3QPZ5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cfap73J3QPZ5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cfap73J3QPZ5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cfap73J3QPZ5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cfap73J3QPZ5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cfap73J3QPZ5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cfap73J3QPZ5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cfap73J3QPZ5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cfap73J3QPZ5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cfap73J3QPZ5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cfap73J3QPZ5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cfap73J3QPZ5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cfap73J3QPZ5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cfap73J3QPZ5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cfap73J3QPZ5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cfap73J3QPZ5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cfap73J3QPZ5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cfap73J3QPZ5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cfap73J3QPZ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cfap73J3QPZ5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cfap73J3QPZ5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cfap73J3QPZ5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cfap73J3QPZ5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cfap73J3QPZ5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cfap73J3QPZ5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cfap73J3QPZ5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cfap73J3QPZ5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cfap73J3QPZ5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cfap73J3QPZ5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cfap73J3QPZ5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cfap73J3QPZ5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cfap73J3QPZ5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cfap73J3QPZ5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cfap73J3QPZ5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cfap73J3QPZ5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cfap73J3QPZ5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cfap73J3QPZ5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cfap73J3QPZ5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cfap73J3QPZ5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cfap73J3QPZ5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cfap73J3QPZ5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cfap73J3QPZ5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cfap73J3QPZ5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cfap73J3QPZ5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cfap73J3QPZ5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cfap73J3QPZ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cfap73J3QPZ5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cfap73J3QPZ5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cfap73J3QPZ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cfap73J3QPZ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cfap73J3QPZ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cfap73J3QPZ5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cfap73J3QPZ5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cfap73J3QPZ5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cfap73J3QPZ5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cfap73J3QPZ5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cfap73J3QPZ5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cfap73J3QPZ5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cfap73J3QPZ5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cfap73J3QPZ5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cfap73J3QPZ5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cfap73J3QPZ5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cfap73J3QPZ5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cfap73J3QPZ5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cfap73J3QPZ5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cfap73J3QPZ5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cfap73J3QPZ5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Cfap73J3QPZ5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cfap73J3QPZ5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cfap73J3QPZ5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cfap73J3QPZ5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cfap73J3QPZ5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cfap73J3QPZ5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cfap73J3QPZ5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cfap73J3QPZ5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cfap73J3QPZ5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cfap73J3QPZ5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cfap73J3QPZ5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cfap73J3QPZ5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cfap73J3QPZ5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cfap73J3QPZ5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cfap73J3QPZ5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cfap73J3QPZ5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cfap73J3QPZ5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cfap73J3QPZ5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cfap73J3QPZ5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cfap73J3QPZ5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cfap73J3QPZ5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cfap73J3QPZ5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms