Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
4930544D05RikJ3QK56 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
4930544D05RikJ3QK56 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
4930544D05RikJ3QK56 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
4930544D05RikJ3QK56 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
4930544D05RikJ3QK56 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
4930544D05RikJ3QK56 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
4930544D05RikJ3QK56 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
4930544D05RikJ3QK56 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
4930544D05RikJ3QK56 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
4930544D05RikJ3QK56 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
4930544D05RikJ3QK56 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
4930544D05RikJ3QK56 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
4930544D05RikJ3QK56 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
4930544D05RikJ3QK56 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
4930544D05RikJ3QK56 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
4930544D05RikJ3QK56 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
4930544D05RikJ3QK56 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
4930544D05RikJ3QK56 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
4930544D05RikJ3QK56 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
4930544D05RikJ3QK56 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
4930544D05RikJ3QK56 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
4930544D05RikJ3QK56 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930544D05RikJ3QK56 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930544D05RikJ3QK56 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930544D05RikJ3QK56 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930544D05RikJ3QK56 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
4930544D05RikJ3QK56 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
4930544D05RikJ3QK56 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
4930544D05RikJ3QK56 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
4930544D05RikJ3QK56 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
4930544D05RikJ3QK56 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
4930544D05RikJ3QK56 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4930544D05RikJ3QK56 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4930544D05RikJ3QK56 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
4930544D05RikJ3QK56 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930544D05RikJ3QK56 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930544D05RikJ3QK56 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930544D05RikJ3QK56 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930544D05RikJ3QK56 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930544D05RikJ3QK56 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930544D05RikJ3QK56 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
4930544D05RikJ3QK56 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
4930544D05RikJ3QK56 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
4930544D05RikJ3QK56 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
4930544D05RikJ3QK56 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
4930544D05RikJ3QK56 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
4930544D05RikJ3QK56 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
4930544D05RikJ3QK56 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
4930544D05RikJ3QK56 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
4930544D05RikJ3QK56 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
4930544D05RikJ3QK56 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
4930544D05RikJ3QK56 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
4930544D05RikJ3QK56 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
4930544D05RikJ3QK56 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
4930544D05RikJ3QK56 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
4930544D05RikJ3QK56 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
4930544D05RikJ3QK56 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
4930544D05RikJ3QK56 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
4930544D05RikJ3QK56 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
4930544D05RikJ3QK56 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
4930544D05RikJ3QK56 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930544D05RikJ3QK56 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930544D05RikJ3QK56 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930544D05RikJ3QK56 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930544D05RikJ3QK56 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930544D05RikJ3QK56 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4930544D05RikJ3QK56 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4930544D05RikJ3QK56 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
4930544D05RikJ3QK56 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930544D05RikJ3QK56 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930544D05RikJ3QK56 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930544D05RikJ3QK56 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930544D05RikJ3QK56 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930544D05RikJ3QK56 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
4930544D05RikJ3QK56 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
4930544D05RikJ3QK56 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
4930544D05RikJ3QK56 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
4930544D05RikJ3QK56 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
4930544D05RikJ3QK56 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930544D05RikJ3QK56 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930544D05RikJ3QK56 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930544D05RikJ3QK56 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4930544D05RikJ3QK56 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4930544D05RikJ3QK56 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
4930544D05RikJ3QK56 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
4930544D05RikJ3QK56 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
4930544D05RikJ3QK56 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
4930544D05RikJ3QK56 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
4930544D05RikJ3QK56 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
4930544D05RikJ3QK56 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930544D05RikJ3QK56 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930544D05RikJ3QK56 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930544D05RikJ3QK56 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930544D05RikJ3QK56 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
4930544D05RikJ3QK56 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
4930544D05RikJ3QK56 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4930544D05RikJ3QK56 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms