Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24,9■■□□□ 1,58
Vmn1r39G3UWE6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24,89■■□□□ 1,58
Vmn1r39G3UWE6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24,89■■□□□ 1,58
Vmn1r39G3UWE6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24,89■■□□□ 1,58
Vmn1r39G3UWE6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Vmn1r39G3UWE6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Vmn1r39G3UWE6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Vmn1r39G3UWE6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Vmn1r39G3UWE6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Vmn1r39G3UWE6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Vmn1r39G3UWE6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Vmn1r39G3UWE6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Vmn1r39G3UWE6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Vmn1r39G3UWE6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Vmn1r39G3UWE6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Vmn1r39G3UWE6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Vmn1r39G3UWE6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Vmn1r39G3UWE6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Vmn1r39G3UWE6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Vmn1r39G3UWE6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Vmn1r39G3UWE6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Vmn1r39G3UWE6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Vmn1r39G3UWE6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Vmn1r39G3UWE6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Vmn1r39G3UWE6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Vmn1r39G3UWE6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24,79■■□□□ 1,56
Vmn1r39G3UWE6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Vmn1r39G3UWE6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24,78■■□□□ 1,56
Vmn1r39G3UWE6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Vmn1r39G3UWE6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24,78■■□□□ 1,56
Vmn1r39G3UWE6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Vmn1r39G3UWE6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Vmn1r39G3UWE6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24,76■■□□□ 1,55
Vmn1r39G3UWE6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24,76■■□□□ 1,55
Vmn1r39G3UWE6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Vmn1r39G3UWE6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Vmn1r39G3UWE6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Vmn1r39G3UWE6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Vmn1r39G3UWE6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Vmn1r39G3UWE6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Vmn1r39G3UWE6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Vmn1r39G3UWE6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Vmn1r39G3UWE6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Vmn1r39G3UWE6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
Vmn1r39G3UWE6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,69■■□□□ 1,54
Vmn1r39G3UWE6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,69■■□□□ 1,54
Vmn1r39G3UWE6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Vmn1r39G3UWE6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Vmn1r39G3UWE6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Vmn1r39G3UWE6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Vmn1r39G3UWE6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Vmn1r39G3UWE6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Vmn1r39G3UWE6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Vmn1r39G3UWE6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Vmn1r39G3UWE6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Vmn1r39G3UWE6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Vmn1r39G3UWE6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Vmn1r39G3UWE6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24,63■■□□□ 1,53
Vmn1r39G3UWE6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Vmn1r39G3UWE6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Vmn1r39G3UWE6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Vmn1r39G3UWE6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Vmn1r39G3UWE6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Vmn1r39G3UWE6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Vmn1r39G3UWE6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Vmn1r39G3UWE6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Vmn1r39G3UWE6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Vmn1r39G3UWE6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Vmn1r39G3UWE6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Vmn1r39G3UWE6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,52
Vmn1r39G3UWE6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Vmn1r39G3UWE6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Vmn1r39G3UWE6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Vmn1r39G3UWE6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Vmn1r39G3UWE6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Vmn1r39G3UWE6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Vmn1r39G3UWE6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Vmn1r39G3UWE6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Vmn1r39G3UWE6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Vmn1r39G3UWE6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Vmn1r39G3UWE6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Vmn1r39G3UWE6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Vmn1r39G3UWE6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Vmn1r39G3UWE6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Vmn1r39G3UWE6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Vmn1r39G3UWE6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Vmn1r39G3UWE6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Vmn1r39G3UWE6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Vmn1r39G3UWE6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Vmn1r39G3UWE6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Vmn1r39G3UWE6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Vmn1r39G3UWE6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Vmn1r39G3UWE6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Vmn1r39G3UWE6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Vmn1r39G3UWE6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Vmn1r39G3UWE6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Vmn1r39G3UWE6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Vmn1r39G3UWE6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Vmn1r39G3UWE6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Vmn1r39G3UWE6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,4■■□□□ 1,5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,5 ms