Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm8220F6YKI2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm8220F6YKI2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm8220F6YKI2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm8220F6YKI2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm8220F6YKI2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm8220F6YKI2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm8220F6YKI2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm8220F6YKI2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm8220F6YKI2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm8220F6YKI2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm8220F6YKI2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm8220F6YKI2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm8220F6YKI2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm8220F6YKI2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm8220F6YKI2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm8220F6YKI2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm8220F6YKI2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm8220F6YKI2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm8220F6YKI2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm8220F6YKI2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm8220F6YKI2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm8220F6YKI2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm8220F6YKI2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm8220F6YKI2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm8220F6YKI2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm8220F6YKI2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm8220F6YKI2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm8220F6YKI2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm8220F6YKI2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm8220F6YKI2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm8220F6YKI2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm8220F6YKI2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm8220F6YKI2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm8220F6YKI2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm8220F6YKI2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm8220F6YKI2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm8220F6YKI2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm8220F6YKI2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm8220F6YKI2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm8220F6YKI2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm8220F6YKI2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm8220F6YKI2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm8220F6YKI2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm8220F6YKI2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm8220F6YKI2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8220F6YKI2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8220F6YKI2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8220F6YKI2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8220F6YKI2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8220F6YKI2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8220F6YKI2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8220F6YKI2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8220F6YKI2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8220F6YKI2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8220F6YKI2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8220F6YKI2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm8220F6YKI2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm8220F6YKI2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm8220F6YKI2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm8220F6YKI2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm8220F6YKI2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8220F6YKI2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8220F6YKI2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8220F6YKI2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8220F6YKI2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8220F6YKI2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8220F6YKI2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8220F6YKI2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8220F6YKI2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8220F6YKI2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8220F6YKI2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8220F6YKI2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8220F6YKI2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8220F6YKI2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8220F6YKI2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8220F6YKI2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8220F6YKI2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8220F6YKI2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8220F6YKI2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8220F6YKI2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8220F6YKI2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8220F6YKI2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm8220F6YKI2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm8220F6YKI2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm8220F6YKI2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8220F6YKI2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8220F6YKI2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8220F6YKI2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8220F6YKI2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8220F6YKI2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm8220F6YKI2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm8220F6YKI2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms