Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21970F6XX07 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21970F6XX07 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21970F6XX07 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21970F6XX07 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21970F6XX07 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21970F6XX07 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21970F6XX07 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21970F6XX07 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21970F6XX07 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21970F6XX07 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm21970F6XX07 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21970F6XX07 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21970F6XX07 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21970F6XX07 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21970F6XX07 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21970F6XX07 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21970F6XX07 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21970F6XX07 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21970F6XX07 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21970F6XX07 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21970F6XX07 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21970F6XX07 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21970F6XX07 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21970F6XX07 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21970F6XX07 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21970F6XX07 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21970F6XX07 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21970F6XX07 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21970F6XX07 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21970F6XX07 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21970F6XX07 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21970F6XX07 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21970F6XX07 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21970F6XX07 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21970F6XX07 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21970F6XX07 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21970F6XX07 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21970F6XX07 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21970F6XX07 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21970F6XX07 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21970F6XX07 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21970F6XX07 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21970F6XX07 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21970F6XX07 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21970F6XX07 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21970F6XX07 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21970F6XX07 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21970F6XX07 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21970F6XX07 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21970F6XX07 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21970F6XX07 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21970F6XX07 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21970F6XX07 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21970F6XX07 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21970F6XX07 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21970F6XX07 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21970F6XX07 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21970F6XX07 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21970F6XX07 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21970F6XX07 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm21970F6XX07 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm21970F6XX07 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21970F6XX07 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21970F6XX07 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21970F6XX07 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21970F6XX07 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21970F6XX07 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21970F6XX07 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21970F6XX07 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21970F6XX07 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21970F6XX07 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21970F6XX07 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21970F6XX07 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21970F6XX07 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21970F6XX07 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21970F6XX07 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21970F6XX07 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21970F6XX07 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21970F6XX07 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21970F6XX07 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm21970F6XX07 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21970F6XX07 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21970F6XX07 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21970F6XX07 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21970F6XX07 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21970F6XX07 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21970F6XX07 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21970F6XX07 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21970F6XX07 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21970F6XX07 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21970F6XX07 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm21970F6XX07 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm21970F6XX07 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm21970F6XX07 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm21970F6XX07 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm21970F6XX07 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm21970F6XX07 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm21970F6XX07 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm21970F6XX07 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms