Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Raph1F2Z3U3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Raph1F2Z3U3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Raph1F2Z3U3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Raph1F2Z3U3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Raph1F2Z3U3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Raph1F2Z3U3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Raph1F2Z3U3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Raph1F2Z3U3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Raph1F2Z3U3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Raph1F2Z3U3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Raph1F2Z3U3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Raph1F2Z3U3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Raph1F2Z3U3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Raph1F2Z3U3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Raph1F2Z3U3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Raph1F2Z3U3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Raph1F2Z3U3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Raph1F2Z3U3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Raph1F2Z3U3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Raph1F2Z3U3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Raph1F2Z3U3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Raph1F2Z3U3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Raph1F2Z3U3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Raph1F2Z3U3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Raph1F2Z3U3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Raph1F2Z3U3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Raph1F2Z3U3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Raph1F2Z3U3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Raph1F2Z3U3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Raph1F2Z3U3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Raph1F2Z3U3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Raph1F2Z3U3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Raph1F2Z3U3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Raph1F2Z3U3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Raph1F2Z3U3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Raph1F2Z3U3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Raph1F2Z3U3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Raph1F2Z3U3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Raph1F2Z3U3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Raph1F2Z3U3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Raph1F2Z3U3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Raph1F2Z3U3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Raph1F2Z3U3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Raph1F2Z3U3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Raph1F2Z3U3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Raph1F2Z3U3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Raph1F2Z3U3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Raph1F2Z3U3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Raph1F2Z3U3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Raph1F2Z3U3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Raph1F2Z3U3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Raph1F2Z3U3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Raph1F2Z3U3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Raph1F2Z3U3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Raph1F2Z3U3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Raph1F2Z3U3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Raph1F2Z3U3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Raph1F2Z3U3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Raph1F2Z3U3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Raph1F2Z3U3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Raph1F2Z3U3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Raph1F2Z3U3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Raph1F2Z3U3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Raph1F2Z3U3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Raph1F2Z3U3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Raph1F2Z3U3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Raph1F2Z3U3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Raph1F2Z3U3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Raph1F2Z3U3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Raph1F2Z3U3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Raph1F2Z3U3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Raph1F2Z3U3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Raph1F2Z3U3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Raph1F2Z3U3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Raph1F2Z3U3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Raph1F2Z3U3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Raph1F2Z3U3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Raph1F2Z3U3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Raph1F2Z3U3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Raph1F2Z3U3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Raph1F2Z3U3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Raph1F2Z3U3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Raph1F2Z3U3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Raph1F2Z3U3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Raph1F2Z3U3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Raph1F2Z3U3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Raph1F2Z3U3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Raph1F2Z3U3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Raph1F2Z3U3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Raph1F2Z3U3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Raph1F2Z3U3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Raph1F2Z3U3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Raph1F2Z3U3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Raph1F2Z3U3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Raph1F2Z3U3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Raph1F2Z3U3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Raph1F2Z3U3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Raph1F2Z3U3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Raph1F2Z3U3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms