Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdr1E9Q0B4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdr1E9Q0B4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdr1E9Q0B4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdr1E9Q0B4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdr1E9Q0B4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdr1E9Q0B4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdr1E9Q0B4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdr1E9Q0B4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdr1E9Q0B4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdr1E9Q0B4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdr1E9Q0B4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdr1E9Q0B4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdr1E9Q0B4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdr1E9Q0B4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdr1E9Q0B4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdr1E9Q0B4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdr1E9Q0B4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdr1E9Q0B4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdr1E9Q0B4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdr1E9Q0B4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdr1E9Q0B4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdr1E9Q0B4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdr1E9Q0B4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdr1E9Q0B4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdr1E9Q0B4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdr1E9Q0B4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdr1E9Q0B4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdr1E9Q0B4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdr1E9Q0B4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdr1E9Q0B4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdr1E9Q0B4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdr1E9Q0B4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdr1E9Q0B4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdr1E9Q0B4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdr1E9Q0B4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdr1E9Q0B4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdr1E9Q0B4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdr1E9Q0B4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdr1E9Q0B4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdr1E9Q0B4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdr1E9Q0B4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdr1E9Q0B4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdr1E9Q0B4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdr1E9Q0B4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdr1E9Q0B4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdr1E9Q0B4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdr1E9Q0B4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdr1E9Q0B4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdr1E9Q0B4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdr1E9Q0B4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdr1E9Q0B4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdr1E9Q0B4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdr1E9Q0B4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdr1E9Q0B4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdr1E9Q0B4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdr1E9Q0B4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdr1E9Q0B4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdr1E9Q0B4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdr1E9Q0B4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdr1E9Q0B4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdr1E9Q0B4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdr1E9Q0B4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdr1E9Q0B4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdr1E9Q0B4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdr1E9Q0B4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdr1E9Q0B4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdr1E9Q0B4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdr1E9Q0B4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdr1E9Q0B4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdr1E9Q0B4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdr1E9Q0B4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdr1E9Q0B4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdr1E9Q0B4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdr1E9Q0B4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdr1E9Q0B4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdr1E9Q0B4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdr1E9Q0B4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdr1E9Q0B4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms