Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7A4

Gm21560, Predicted gene, 21560, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21560D3Z7A4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm21560D3Z7A4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm21560D3Z7A4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm21560D3Z7A4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm21560D3Z7A4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm21560D3Z7A4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm21560D3Z7A4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm21560D3Z7A4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm21560D3Z7A4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm21560D3Z7A4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm21560D3Z7A4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm21560D3Z7A4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm21560D3Z7A4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm21560D3Z7A4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm21560D3Z7A4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm21560D3Z7A4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm21560D3Z7A4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm21560D3Z7A4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm21560D3Z7A4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm21560D3Z7A4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm21560D3Z7A4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm21560D3Z7A4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm21560D3Z7A4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm21560D3Z7A4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm21560D3Z7A4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm21560D3Z7A4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm21560D3Z7A4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm21560D3Z7A4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm21560D3Z7A4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm21560D3Z7A4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm21560D3Z7A4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm21560D3Z7A4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm21560D3Z7A4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm21560D3Z7A4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm21560D3Z7A4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm21560D3Z7A4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm21560D3Z7A4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm21560D3Z7A4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm21560D3Z7A4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm21560D3Z7A4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm21560D3Z7A4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm21560D3Z7A4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm21560D3Z7A4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm21560D3Z7A4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm21560D3Z7A4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm21560D3Z7A4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm21560D3Z7A4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm21560D3Z7A4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm21560D3Z7A4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm21560D3Z7A4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm21560D3Z7A4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm21560D3Z7A4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm21560D3Z7A4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm21560D3Z7A4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm21560D3Z7A4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm21560D3Z7A4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm21560D3Z7A4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm21560D3Z7A4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm21560D3Z7A4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm21560D3Z7A4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm21560D3Z7A4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm21560D3Z7A4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm21560D3Z7A4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm21560D3Z7A4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm21560D3Z7A4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm21560D3Z7A4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm21560D3Z7A4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm21560D3Z7A4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm21560D3Z7A4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm21560D3Z7A4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm21560D3Z7A4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm21560D3Z7A4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm21560D3Z7A4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm21560D3Z7A4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.1 ms