Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp6ap1lD3Z5W0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp6ap1lD3Z5W0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp6ap1lD3Z5W0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp6ap1lD3Z5W0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp6ap1lD3Z5W0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp6ap1lD3Z5W0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp6ap1lD3Z5W0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp6ap1lD3Z5W0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp6ap1lD3Z5W0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp6ap1lD3Z5W0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp6ap1lD3Z5W0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp6ap1lD3Z5W0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp6ap1lD3Z5W0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp6ap1lD3Z5W0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp6ap1lD3Z5W0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp6ap1lD3Z5W0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms