Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3543D3Z235 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3543D3Z235 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3543D3Z235 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3543D3Z235 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3543D3Z235 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3543D3Z235 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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