Protein–RNA interactions for Protein: C8YR32

Loxhd1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxhd1C8YR32 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Loxhd1C8YR32 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Loxhd1C8YR32 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Loxhd1C8YR32 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Loxhd1C8YR32 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Loxhd1C8YR32 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Loxhd1C8YR32 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Loxhd1C8YR32 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Loxhd1C8YR32 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Loxhd1C8YR32 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Loxhd1C8YR32 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Loxhd1C8YR32 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Loxhd1C8YR32 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Loxhd1C8YR32 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Loxhd1C8YR32 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Loxhd1C8YR32 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Loxhd1C8YR32 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Loxhd1C8YR32 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Loxhd1C8YR32 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Loxhd1C8YR32 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Loxhd1C8YR32 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Loxhd1C8YR32 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Loxhd1C8YR32 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Loxhd1C8YR32 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Loxhd1C8YR32 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Loxhd1C8YR32 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Loxhd1C8YR32 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Loxhd1C8YR32 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Loxhd1C8YR32 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Loxhd1C8YR32 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Loxhd1C8YR32 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Loxhd1C8YR32 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Loxhd1C8YR32 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Loxhd1C8YR32 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Loxhd1C8YR32 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Loxhd1C8YR32 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Loxhd1C8YR32 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Loxhd1C8YR32 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Loxhd1C8YR32 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Loxhd1C8YR32 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Loxhd1C8YR32 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Loxhd1C8YR32 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Loxhd1C8YR32 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Loxhd1C8YR32 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Loxhd1C8YR32 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Loxhd1C8YR32 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Loxhd1C8YR32 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Loxhd1C8YR32 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Loxhd1C8YR32 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Loxhd1C8YR32 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Loxhd1C8YR32 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Loxhd1C8YR32 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Loxhd1C8YR32 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Loxhd1C8YR32 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Loxhd1C8YR32 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Loxhd1C8YR32 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Loxhd1C8YR32 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Loxhd1C8YR32 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Loxhd1C8YR32 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Loxhd1C8YR32 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Loxhd1C8YR32 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Loxhd1C8YR32 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Loxhd1C8YR32 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Loxhd1C8YR32 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Loxhd1C8YR32 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Loxhd1C8YR32 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Loxhd1C8YR32 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Loxhd1C8YR32 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Loxhd1C8YR32 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Loxhd1C8YR32 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Loxhd1C8YR32 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Loxhd1C8YR32 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Loxhd1C8YR32 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Loxhd1C8YR32 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Loxhd1C8YR32 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Loxhd1C8YR32 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Loxhd1C8YR32 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Loxhd1C8YR32 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Loxhd1C8YR32 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Loxhd1C8YR32 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Loxhd1C8YR32 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Loxhd1C8YR32 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Loxhd1C8YR32 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Loxhd1C8YR32 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Loxhd1C8YR32 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Loxhd1C8YR32 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Loxhd1C8YR32 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Loxhd1C8YR32 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Loxhd1C8YR32 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Loxhd1C8YR32 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Loxhd1C8YR32 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Loxhd1C8YR32 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Loxhd1C8YR32 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Loxhd1C8YR32 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Loxhd1C8YR32 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Loxhd1C8YR32 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Loxhd1C8YR32 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Loxhd1C8YR32 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Loxhd1C8YR32 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Loxhd1C8YR32 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms