Protein–RNA interactions for Protein: B2RQE8

Arhgap42, Rho GTPase-activating protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap42B2RQE8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arhgap42B2RQE8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arhgap42B2RQE8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arhgap42B2RQE8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arhgap42B2RQE8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arhgap42B2RQE8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arhgap42B2RQE8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arhgap42B2RQE8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arhgap42B2RQE8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arhgap42B2RQE8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arhgap42B2RQE8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Arhgap42B2RQE8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arhgap42B2RQE8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arhgap42B2RQE8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arhgap42B2RQE8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgap42B2RQE8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgap42B2RQE8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgap42B2RQE8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgap42B2RQE8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgap42B2RQE8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgap42B2RQE8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgap42B2RQE8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgap42B2RQE8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgap42B2RQE8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgap42B2RQE8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Arhgap42B2RQE8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgap42B2RQE8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgap42B2RQE8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgap42B2RQE8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgap42B2RQE8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgap42B2RQE8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgap42B2RQE8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgap42B2RQE8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgap42B2RQE8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arhgap42B2RQE8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgap42B2RQE8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgap42B2RQE8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgap42B2RQE8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgap42B2RQE8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arhgap42B2RQE8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arhgap42B2RQE8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arhgap42B2RQE8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Arhgap42B2RQE8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arhgap42B2RQE8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arhgap42B2RQE8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgap42B2RQE8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgap42B2RQE8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgap42B2RQE8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgap42B2RQE8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgap42B2RQE8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgap42B2RQE8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgap42B2RQE8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgap42B2RQE8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgap42B2RQE8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgap42B2RQE8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgap42B2RQE8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgap42B2RQE8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgap42B2RQE8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgap42B2RQE8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgap42B2RQE8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgap42B2RQE8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgap42B2RQE8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgap42B2RQE8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arhgap42B2RQE8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgap42B2RQE8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgap42B2RQE8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgap42B2RQE8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgap42B2RQE8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Arhgap42B2RQE8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arhgap42B2RQE8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgap42B2RQE8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgap42B2RQE8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgap42B2RQE8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgap42B2RQE8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgap42B2RQE8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgap42B2RQE8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgap42B2RQE8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgap42B2RQE8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arhgap42B2RQE8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arhgap42B2RQE8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Arhgap42B2RQE8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arhgap42B2RQE8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arhgap42B2RQE8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arhgap42B2RQE8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Arhgap42B2RQE8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Arhgap42B2RQE8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arhgap42B2RQE8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arhgap42B2RQE8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arhgap42B2RQE8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arhgap42B2RQE8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arhgap42B2RQE8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arhgap42B2RQE8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arhgap42B2RQE8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arhgap42B2RQE8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arhgap42B2RQE8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgap42B2RQE8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgap42B2RQE8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgap42B2RQE8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arhgap42B2RQE8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arhgap42B2RQE8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms