Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Supt3B0QZW4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Supt3B0QZW4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Supt3B0QZW4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Supt3B0QZW4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Supt3B0QZW4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Supt3B0QZW4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Supt3B0QZW4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Supt3B0QZW4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Supt3B0QZW4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Supt3B0QZW4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Supt3B0QZW4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Supt3B0QZW4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Supt3B0QZW4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Supt3B0QZW4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Supt3B0QZW4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Supt3B0QZW4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Supt3B0QZW4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Supt3B0QZW4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Supt3B0QZW4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Supt3B0QZW4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Supt3B0QZW4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt3B0QZW4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt3B0QZW4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Supt3B0QZW4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Supt3B0QZW4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Supt3B0QZW4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Supt3B0QZW4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt3B0QZW4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt3B0QZW4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt3B0QZW4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Supt3B0QZW4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Supt3B0QZW4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Supt3B0QZW4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Supt3B0QZW4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Supt3B0QZW4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Supt3B0QZW4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Supt3B0QZW4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Supt3B0QZW4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Supt3B0QZW4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Supt3B0QZW4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Supt3B0QZW4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Supt3B0QZW4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Supt3B0QZW4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Supt3B0QZW4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Supt3B0QZW4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Supt3B0QZW4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Supt3B0QZW4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Supt3B0QZW4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Supt3B0QZW4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Supt3B0QZW4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Supt3B0QZW4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Supt3B0QZW4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Supt3B0QZW4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Supt3B0QZW4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Supt3B0QZW4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Supt3B0QZW4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Supt3B0QZW4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Supt3B0QZW4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Supt3B0QZW4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Supt3B0QZW4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Supt3B0QZW4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Supt3B0QZW4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Supt3B0QZW4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Supt3B0QZW4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Supt3B0QZW4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Supt3B0QZW4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Supt3B0QZW4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Supt3B0QZW4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Supt3B0QZW4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Supt3B0QZW4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Supt3B0QZW4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Supt3B0QZW4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Supt3B0QZW4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Supt3B0QZW4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Supt3B0QZW4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Supt3B0QZW4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Supt3B0QZW4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Supt3B0QZW4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Supt3B0QZW4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Supt3B0QZW4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Supt3B0QZW4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Supt3B0QZW4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Supt3B0QZW4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Supt3B0QZW4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Supt3B0QZW4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Supt3B0QZW4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Supt3B0QZW4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Supt3B0QZW4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Supt3B0QZW4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Supt3B0QZW4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Supt3B0QZW4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Supt3B0QZW4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Supt3B0QZW4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt3B0QZW4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt3B0QZW4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt3B0QZW4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt3B0QZW4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt3B0QZW4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt3B0QZW4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms