Protein–RNA interactions for Protein: A9YVJ5

Gbp11, Guanylate binding protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp11A9YVJ5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gbp11A9YVJ5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gbp11A9YVJ5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gbp11A9YVJ5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gbp11A9YVJ5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gbp11A9YVJ5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gbp11A9YVJ5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gbp11A9YVJ5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gbp11A9YVJ5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gbp11A9YVJ5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp11A9YVJ5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp11A9YVJ5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gbp11A9YVJ5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gbp11A9YVJ5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gbp11A9YVJ5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gbp11A9YVJ5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gbp11A9YVJ5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gbp11A9YVJ5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gbp11A9YVJ5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gbp11A9YVJ5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gbp11A9YVJ5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gbp11A9YVJ5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gbp11A9YVJ5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gbp11A9YVJ5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gbp11A9YVJ5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp11A9YVJ5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp11A9YVJ5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp11A9YVJ5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp11A9YVJ5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp11A9YVJ5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp11A9YVJ5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gbp11A9YVJ5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp11A9YVJ5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp11A9YVJ5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp11A9YVJ5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp11A9YVJ5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp11A9YVJ5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp11A9YVJ5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp11A9YVJ5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp11A9YVJ5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp11A9YVJ5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp11A9YVJ5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp11A9YVJ5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp11A9YVJ5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gbp11A9YVJ5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp11A9YVJ5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp11A9YVJ5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp11A9YVJ5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp11A9YVJ5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp11A9YVJ5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gbp11A9YVJ5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp11A9YVJ5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp11A9YVJ5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp11A9YVJ5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp11A9YVJ5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp11A9YVJ5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp11A9YVJ5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp11A9YVJ5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp11A9YVJ5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp11A9YVJ5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp11A9YVJ5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp11A9YVJ5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp11A9YVJ5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp11A9YVJ5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp11A9YVJ5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp11A9YVJ5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp11A9YVJ5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp11A9YVJ5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp11A9YVJ5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp11A9YVJ5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp11A9YVJ5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp11A9YVJ5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp11A9YVJ5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp11A9YVJ5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp11A9YVJ5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp11A9YVJ5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp11A9YVJ5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp11A9YVJ5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp11A9YVJ5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp11A9YVJ5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp11A9YVJ5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp11A9YVJ5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp11A9YVJ5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp11A9YVJ5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp11A9YVJ5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp11A9YVJ5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp11A9YVJ5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp11A9YVJ5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp11A9YVJ5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp11A9YVJ5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp11A9YVJ5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp11A9YVJ5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp11A9YVJ5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp11A9YVJ5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp11A9YVJ5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Gbp11A9YVJ5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gbp11A9YVJ5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gbp11A9YVJ5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp11A9YVJ5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp11A9YVJ5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms