Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Plcb2A3KGF7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Plcb2A3KGF7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Plcb2A3KGF7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Plcb2A3KGF7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Plcb2A3KGF7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Plcb2A3KGF7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Plcb2A3KGF7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Plcb2A3KGF7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Plcb2A3KGF7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Plcb2A3KGF7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Plcb2A3KGF7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Plcb2A3KGF7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Plcb2A3KGF7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Plcb2A3KGF7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Plcb2A3KGF7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Plcb2A3KGF7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Plcb2A3KGF7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Plcb2A3KGF7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Plcb2A3KGF7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Plcb2A3KGF7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Plcb2A3KGF7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Plcb2A3KGF7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Plcb2A3KGF7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Plcb2A3KGF7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Plcb2A3KGF7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Plcb2A3KGF7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Plcb2A3KGF7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Plcb2A3KGF7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Plcb2A3KGF7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Plcb2A3KGF7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Plcb2A3KGF7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Plcb2A3KGF7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Plcb2A3KGF7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Plcb2A3KGF7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Plcb2A3KGF7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Plcb2A3KGF7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Plcb2A3KGF7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Plcb2A3KGF7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Plcb2A3KGF7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Plcb2A3KGF7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Plcb2A3KGF7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Plcb2A3KGF7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Plcb2A3KGF7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Plcb2A3KGF7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Plcb2A3KGF7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Plcb2A3KGF7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Plcb2A3KGF7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Plcb2A3KGF7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Plcb2A3KGF7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Plcb2A3KGF7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Plcb2A3KGF7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Plcb2A3KGF7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Plcb2A3KGF7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Plcb2A3KGF7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plcb2A3KGF7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plcb2A3KGF7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plcb2A3KGF7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plcb2A3KGF7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Plcb2A3KGF7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Plcb2A3KGF7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Plcb2A3KGF7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Plcb2A3KGF7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Plcb2A3KGF7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Plcb2A3KGF7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Plcb2A3KGF7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Plcb2A3KGF7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Plcb2A3KGF7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Plcb2A3KGF7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Plcb2A3KGF7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Plcb2A3KGF7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Plcb2A3KGF7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Plcb2A3KGF7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Plcb2A3KGF7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Plcb2A3KGF7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Plcb2A3KGF7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Plcb2A3KGF7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Plcb2A3KGF7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Plcb2A3KGF7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Plcb2A3KGF7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Plcb2A3KGF7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Plcb2A3KGF7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Plcb2A3KGF7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Plcb2A3KGF7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Plcb2A3KGF7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Plcb2A3KGF7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Plcb2A3KGF7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Plcb2A3KGF7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Plcb2A3KGF7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Plcb2A3KGF7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Plcb2A3KGF7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Plcb2A3KGF7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Plcb2A3KGF7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Plcb2A3KGF7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Plcb2A3KGF7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Plcb2A3KGF7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Plcb2A3KGF7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Plcb2A3KGF7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Plcb2A3KGF7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Plcb2A3KGF7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms