Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Btbd35f28A2CFD5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Btbd35f28A2CFD5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Btbd35f28A2CFD5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Btbd35f28A2CFD5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Btbd35f28A2CFD5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Btbd35f28A2CFD5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Btbd35f28A2CFD5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Btbd35f28A2CFD5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Btbd35f28A2CFD5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Btbd35f28A2CFD5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Btbd35f28A2CFD5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Btbd35f28A2CFD5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Btbd35f28A2CFD5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Btbd35f28A2CFD5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Btbd35f28A2CFD5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Btbd35f28A2CFD5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Btbd35f28A2CFD5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Btbd35f28A2CFD5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Btbd35f28A2CFD5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Btbd35f28A2CFD5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Btbd35f28A2CFD5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Btbd35f28A2CFD5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Btbd35f28A2CFD5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Btbd35f28A2CFD5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Btbd35f28A2CFD5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Btbd35f28A2CFD5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Btbd35f28A2CFD5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Btbd35f28A2CFD5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Btbd35f28A2CFD5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Btbd35f28A2CFD5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Btbd35f28A2CFD5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Btbd35f28A2CFD5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Btbd35f28A2CFD5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Btbd35f28A2CFD5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Btbd35f28A2CFD5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Btbd35f28A2CFD5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Btbd35f28A2CFD5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Btbd35f28A2CFD5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Btbd35f28A2CFD5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Btbd35f28A2CFD5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Btbd35f28A2CFD5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Btbd35f28A2CFD5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Btbd35f28A2CFD5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Btbd35f28A2CFD5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Btbd35f28A2CFD5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Btbd35f28A2CFD5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Btbd35f28A2CFD5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Btbd35f28A2CFD5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Btbd35f28A2CFD5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Btbd35f28A2CFD5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Btbd35f28A2CFD5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Btbd35f28A2CFD5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Btbd35f28A2CFD5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Btbd35f28A2CFD5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms