Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT6

Vmn1r2, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r2A2AMT6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r2A2AMT6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r2A2AMT6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r2A2AMT6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r2A2AMT6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r2A2AMT6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r2A2AMT6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r2A2AMT6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r2A2AMT6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r2A2AMT6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r2A2AMT6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r2A2AMT6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r2A2AMT6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r2A2AMT6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r2A2AMT6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r2A2AMT6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r2A2AMT6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r2A2AMT6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r2A2AMT6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r2A2AMT6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r2A2AMT6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r2A2AMT6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vmn1r2A2AMT6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r2A2AMT6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r2A2AMT6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r2A2AMT6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r2A2AMT6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r2A2AMT6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r2A2AMT6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r2A2AMT6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r2A2AMT6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r2A2AMT6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r2A2AMT6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r2A2AMT6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r2A2AMT6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r2A2AMT6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r2A2AMT6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r2A2AMT6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r2A2AMT6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r2A2AMT6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r2A2AMT6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vmn1r2A2AMT6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r2A2AMT6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r2A2AMT6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r2A2AMT6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r2A2AMT6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r2A2AMT6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r2A2AMT6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r2A2AMT6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r2A2AMT6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r2A2AMT6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r2A2AMT6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r2A2AMT6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r2A2AMT6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r2A2AMT6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r2A2AMT6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r2A2AMT6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vmn1r2A2AMT6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r2A2AMT6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r2A2AMT6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r2A2AMT6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r2A2AMT6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r2A2AMT6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r2A2AMT6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r2A2AMT6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r2A2AMT6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r2A2AMT6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r2A2AMT6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r2A2AMT6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r2A2AMT6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r2A2AMT6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r2A2AMT6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r2A2AMT6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r2A2AMT6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r2A2AMT6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r2A2AMT6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r2A2AMT6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms