Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lcn6A2AJB9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lcn6A2AJB9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lcn6A2AJB9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lcn6A2AJB9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lcn6A2AJB9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lcn6A2AJB9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lcn6A2AJB9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lcn6A2AJB9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Lcn6A2AJB9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lcn6A2AJB9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lcn6A2AJB9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lcn6A2AJB9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lcn6A2AJB9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lcn6A2AJB9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lcn6A2AJB9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lcn6A2AJB9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lcn6A2AJB9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lcn6A2AJB9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lcn6A2AJB9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lcn6A2AJB9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lcn6A2AJB9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lcn6A2AJB9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lcn6A2AJB9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lcn6A2AJB9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lcn6A2AJB9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Lcn6A2AJB9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Lcn6A2AJB9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lcn6A2AJB9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lcn6A2AJB9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lcn6A2AJB9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lcn6A2AJB9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lcn6A2AJB9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Lcn6A2AJB9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lcn6A2AJB9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lcn6A2AJB9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lcn6A2AJB9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lcn6A2AJB9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lcn6A2AJB9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lcn6A2AJB9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lcn6A2AJB9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lcn6A2AJB9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lcn6A2AJB9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lcn6A2AJB9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lcn6A2AJB9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lcn6A2AJB9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lcn6A2AJB9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lcn6A2AJB9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lcn6A2AJB9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lcn6A2AJB9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lcn6A2AJB9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lcn6A2AJB9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lcn6A2AJB9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lcn6A2AJB9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lcn6A2AJB9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lcn6A2AJB9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lcn6A2AJB9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Lcn6A2AJB9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lcn6A2AJB9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lcn6A2AJB9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lcn6A2AJB9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lcn6A2AJB9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lcn6A2AJB9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lcn6A2AJB9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lcn6A2AJB9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lcn6A2AJB9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lcn6A2AJB9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lcn6A2AJB9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lcn6A2AJB9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lcn6A2AJB9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Lcn6A2AJB9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lcn6A2AJB9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lcn6A2AJB9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lcn6A2AJB9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lcn6A2AJB9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lcn6A2AJB9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lcn6A2AJB9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lcn6A2AJB9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lcn6A2AJB9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lcn6A2AJB9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lcn6A2AJB9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lcn6A2AJB9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lcn6A2AJB9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lcn6A2AJB9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lcn6A2AJB9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lcn6A2AJB9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lcn6A2AJB9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lcn6A2AJB9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lcn6A2AJB9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lcn6A2AJB9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lcn6A2AJB9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lcn6A2AJB9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lcn6A2AJB9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lcn6A2AJB9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lcn6A2AJB9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lcn6A2AJB9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lcn6A2AJB9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lcn6A2AJB9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lcn6A2AJB9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lcn6A2AJB9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms