Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc173A0JLY1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc173A0JLY1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc173A0JLY1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc173A0JLY1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc173A0JLY1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc173A0JLY1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc173A0JLY1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc173A0JLY1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc173A0JLY1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc173A0JLY1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc173A0JLY1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc173A0JLY1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc173A0JLY1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ccdc173A0JLY1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc173A0JLY1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc173A0JLY1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc173A0JLY1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc173A0JLY1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc173A0JLY1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc173A0JLY1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc173A0JLY1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc173A0JLY1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc173A0JLY1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc173A0JLY1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc173A0JLY1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc173A0JLY1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc173A0JLY1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc173A0JLY1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc173A0JLY1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc173A0JLY1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc173A0JLY1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc173A0JLY1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc173A0JLY1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc173A0JLY1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc173A0JLY1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc173A0JLY1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc173A0JLY1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc173A0JLY1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc173A0JLY1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc173A0JLY1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc173A0JLY1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc173A0JLY1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc173A0JLY1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc173A0JLY1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc173A0JLY1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc173A0JLY1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc173A0JLY1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc173A0JLY1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc173A0JLY1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc173A0JLY1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc173A0JLY1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc173A0JLY1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc173A0JLY1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc173A0JLY1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc173A0JLY1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc173A0JLY1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc173A0JLY1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc173A0JLY1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc173A0JLY1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc173A0JLY1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc173A0JLY1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc173A0JLY1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc173A0JLY1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc173A0JLY1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc173A0JLY1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc173A0JLY1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc173A0JLY1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc173A0JLY1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc173A0JLY1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc173A0JLY1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc173A0JLY1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc173A0JLY1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc173A0JLY1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc173A0JLY1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc173A0JLY1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc173A0JLY1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc173A0JLY1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc173A0JLY1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc173A0JLY1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc173A0JLY1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc173A0JLY1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc173A0JLY1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc173A0JLY1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc173A0JLY1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc173A0JLY1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc173A0JLY1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc173A0JLY1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc173A0JLY1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc173A0JLY1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc173A0JLY1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc173A0JLY1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc173A0JLY1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc173A0JLY1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc173A0JLY1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc173A0JLY1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc173A0JLY1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc173A0JLY1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc173A0JLY1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms