Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YE38

4932443I19Rik, RIKEN cDNA 4932443I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4932443I19RikA0A286YE38 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4932443I19RikA0A286YE38 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4932443I19RikA0A286YE38 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4932443I19RikA0A286YE38 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4932443I19RikA0A286YE38 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4932443I19RikA0A286YE38 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4932443I19RikA0A286YE38 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4932443I19RikA0A286YE38 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
4932443I19RikA0A286YE38 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4932443I19RikA0A286YE38 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4932443I19RikA0A286YE38 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4932443I19RikA0A286YE38 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4932443I19RikA0A286YE38 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4932443I19RikA0A286YE38 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4932443I19RikA0A286YE38 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4932443I19RikA0A286YE38 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4932443I19RikA0A286YE38 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
4932443I19RikA0A286YE38 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4932443I19RikA0A286YE38 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4932443I19RikA0A286YE38 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4932443I19RikA0A286YE38 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4932443I19RikA0A286YE38 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4932443I19RikA0A286YE38 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4932443I19RikA0A286YE38 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
4932443I19RikA0A286YE38 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4932443I19RikA0A286YE38 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4932443I19RikA0A286YE38 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4932443I19RikA0A286YE38 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4932443I19RikA0A286YE38 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4932443I19RikA0A286YE38 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4932443I19RikA0A286YE38 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4932443I19RikA0A286YE38 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4932443I19RikA0A286YE38 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4932443I19RikA0A286YE38 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
4932443I19RikA0A286YE38 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4932443I19RikA0A286YE38 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4932443I19RikA0A286YE38 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
4932443I19RikA0A286YE38 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
4932443I19RikA0A286YE38 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4932443I19RikA0A286YE38 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4932443I19RikA0A286YE38 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4932443I19RikA0A286YE38 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4932443I19RikA0A286YE38 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4932443I19RikA0A286YE38 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4932443I19RikA0A286YE38 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
4932443I19RikA0A286YE38 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4932443I19RikA0A286YE38 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4932443I19RikA0A286YE38 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
4932443I19RikA0A286YE38 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4932443I19RikA0A286YE38 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4932443I19RikA0A286YE38 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4932443I19RikA0A286YE38 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
4932443I19RikA0A286YE38 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4932443I19RikA0A286YE38 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4932443I19RikA0A286YE38 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4932443I19RikA0A286YE38 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4932443I19RikA0A286YE38 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4932443I19RikA0A286YE38 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4932443I19RikA0A286YE38 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4932443I19RikA0A286YE38 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
4932443I19RikA0A286YE38 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4932443I19RikA0A286YE38 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4932443I19RikA0A286YE38 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4932443I19RikA0A286YE38 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4932443I19RikA0A286YE38 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4932443I19RikA0A286YE38 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4932443I19RikA0A286YE38 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4932443I19RikA0A286YE38 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4932443I19RikA0A286YE38 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4932443I19RikA0A286YE38 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4932443I19RikA0A286YE38 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4932443I19RikA0A286YE38 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4932443I19RikA0A286YE38 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4932443I19RikA0A286YE38 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4932443I19RikA0A286YE38 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4932443I19RikA0A286YE38 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4932443I19RikA0A286YE38 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4932443I19RikA0A286YE38 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4932443I19RikA0A286YE38 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4932443I19RikA0A286YE38 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
4932443I19RikA0A286YE38 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4932443I19RikA0A286YE38 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
4932443I19RikA0A286YE38 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4932443I19RikA0A286YE38 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4932443I19RikA0A286YE38 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4932443I19RikA0A286YE38 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4932443I19RikA0A286YE38 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4932443I19RikA0A286YE38 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
4932443I19RikA0A286YE38 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
4932443I19RikA0A286YE38 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
4932443I19RikA0A286YE38 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4932443I19RikA0A286YE38 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4932443I19RikA0A286YE38 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4932443I19RikA0A286YE38 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4932443I19RikA0A286YE38 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4932443I19RikA0A286YE38 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4932443I19RikA0A286YE38 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4932443I19RikA0A286YE38 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4932443I19RikA0A286YE38 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4932443I19RikA0A286YE38 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms