Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms