Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms