Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms